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miRNA芯片数据分析

miRNA表达谱芯片数据标准分析:
1、表达差异分析
对于使用参照实验设计进行的重复实验, 可以对多个样本的基因表达数据进行差异基因表达分析, 具体方法包括差异倍数分析、t检验等。
2、聚类分析
聚类分析是通过建立各种不同的数学模型,把基于相似数据特征的变量或样本组合在一起。归为一个簇的基因在功能上可能相似或关联,从而找到未知基因的功能信息或已知基因的未知功能。

miRNA表达谱芯片数据高级分析:
1、miRNA标志物筛选分析
从庞大的芯片数据中找出能作为Biomarker的miRNA,并以此构建模型,达到区别不同组织、状态或类型的生物样品的目的,以便于进行早期诊断、疾病预测和预后分析,是miRNA表达谱芯片的重要应用。
注:需提供足量的miRNA表达谱芯片样本。
2、miRNA靶基因预测及信号通路分析
靶基因预测是miRNA功能研究上的有力工具。通过对多个数据库的靶基因预测结果统计,可以进一步缩小靶基因范围,为实验验证提供指导。结合基因表达谱芯片检测结果,可以更有效地分析miRNA靶基因。
注:可供选择的数据库:TargetScan, miRanda, StarBase, miRDB,picTar, DIANA等。
图 多种工具对miRNA靶基因的综合预测

3、miRNA靶基因调控网络构建
miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可能有多个靶基因,而一个基因很可能受多个miRNA的调控。miRNA调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。
针对客户感兴趣的若干个特定miRNA,锐博生物运用生物信息学的方法和技术通过文献挖掘研究复杂的miRNA调控网络关系,揭示有关的作用机理,为您的科学研究的创新提供帮助!

图 miRNA调控网络

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