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lncRNA芯片数据分析

lncRNA表达谱芯片数据标准分析


1、表达差异分析

对于使用参照实验设计进行的重复实验, 可以对多个样本的基因表达数据进行差异基因表达分析, 具体方法包括倍数分析、t检验等。


2、聚类分析

聚类分析是通过建立各种不同的数学模型,它把基于相似数据特征的变量或样本组合在一起,归为一个簇的基因在功能上可能相似或关联,从而找到未知基因的功能信息或已知基因的未知功能。

图 聚类分析


lncRNA表达谱芯片数据高级分析


使用包含lncRNA探针的芯片数据,可以分析lncRNA与基因之间存在的共表达关系,进而用生物信息学方法对lncRNA的功能进行探索。共表达关系可能就是lncRNA与基因相互调控的结果。

适用范围:编码基因与非编码RNA混合型芯片。

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