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个性化统计与绘图

芯片比较特征图

分析目的:特定基因/miRNA在多样品间的表达差异统计。

适用芯片类型:基因表达谱芯片、miRNA表达谱芯片、lncRNA表达谱芯片等。

芯片数量要求:至少两组,各5片。

统计miRNA-a和miRNA-b在3个实验组与1个对照组中的表达量情况,并且统计其P value。

“**”表示具有表达差异显著性。

箱线图(Box-plots)

分析目的:箱线图利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法,它也可以系统性地看出数据是否具有对称性。

适用范围:基因表达谱芯片、miRNA表达谱芯片、lncRNA表达谱芯片等。

芯片数量要求:至少2片。


使用箱线图表示8个样本中被检测基因的信号值分布情况。


相似度矩阵(Similarity matrices)

分析目的:相似度矩阵用来分析特定的数个被检测对象在样本之间的表达相似度。

适用芯片类型:基因表达谱芯片、miRNA表达谱芯片、lncRNA表达谱芯片等。

芯片数量要求:至少2片。

相似度矩阵分析特定的数个miRNA在两组样本中的表达相似度。

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